本局隸屬於臺北市政府，為本府一級機關，置局長、副局長、主任秘書及專門委員，下設5科5室，組織架構圖如下：
局本部包含局長、副局長、主任秘書、專門委員、機要秘書、機要科員。
本局各單位職掌如下：
一、區政監督科：行政區劃、區政監督、區政發展、區里組織、區級災情監控、輿情整合及不屬各科之區政等事項。
二、自治行政科：地方自治、里鄰長福利、研習、考核、里鄰基層會議、里鄰基層建設、公民會館、區民活動中心、里民活動場所、民生社區中心管理及協辦公職人員選舉罷免等事項。
三、宗教禮俗科：本市宗教行政、宗教輔導、祭祀公業、神明會、殯葬、禮俗、基層藝文、祭祀儀典及各項慶典活動、傑出市民遴選表揚、調解業務、非政府組織會館及林安泰民俗文物館經營管理、孔廟管理委員會業務監督等事項。
四、戶籍行政科：各項戶籍登記、戶籍行政、戶籍資料、道路命名、門牌編釘之規劃推展、戶政人員之教育訓練及戶政事務所業務之監督考核等事項。
五、人口政策科：人口政策規劃、宣導、國籍案件審查、新住民輔導及新住民會館經營管理等事項。
六、秘書室：綜合業務、研究發展、法制、施政計畫、公文時效管制、事務、出納、文書、檔案管理及不屬其他科、室之事項。
七、資訊室：民政資訊系統之整體規劃、發展、協調、推動、管理、維護、訓練及督導等事項。
八、會計室：依法辦理歲計、會計及統計事項。
九、人事室：依法辦理人事管理事項。
十、政風室：依法辦理政風事項。
